户籍丢失可能有以下几种原因：
乡镇管理不规范：
在户口归公安机关管理前，户口多由乡镇管理，由于管理不规范和随意性大，可能导致没有相应的户籍资料。
未及时申报户口：
现阶段，有些小孩出生后没有及时向公安机关申报户口，导致户籍资料缺失。
户口迁移过程中资料丢失：
在户口迁移过程中，户籍资料可能没有及时送达迁入地的公安机关，或在迁移过程中相应材料丢失。
人为因素：
曾经迁出但最后未能落地，原记录丢失；或者曾经被人为地因某事注销了户口。
户籍管理员疏忽：
户籍管理员在进行电脑录取资料时，可能因粗心大意漏掉某些资料。
系统错误：
二代身份证一直没办可能是派出所户籍工作人员误销户，或是微机系统错误。
迁移或消失记录不明确：
户籍撤销也会有详细的记录，但如果这些记录不明确，可能导致户籍无法找到。
建议采取以下措施来补办户籍：
准备个人申请、村委会或居委会证明、计生办证明、医院出生证等相关证据。
搜集当年村委会或居委会的户口底册，以说明问题。
到派出所进行补充登记，说明情况并进行补办手续。
如果需要，可以联系上级主管部门查明原因并协助解决问题。
